Marcos Azambuja foi Conselheiro Emérito do Centro Brasileiro de Relações Internacionais (CEBRI).

Serviu como Embaixador do Brasil na Argentina (1992–1997) e na França (1997–2003), além de chefiar a Delegação do Brasil para Assuntos de Desarmamento e Direitos Humanos em Genebra (1989–1990).

Foi Coordenador da Conferência das Nações Unidas sobre Meio Ambiente e Desenvolvimento (Cúpula da Terra – Rio-92). No Ministério das Relações Exteriores, atuou como Secretário-Geral (Vice-Chanceler) e exerceu funções diplomáticas em Londres, Cidade do México e Nova York (Nações Unidas).

Foi membro da Comissão sobre Armas de Destruição em Massa e do Fórum de Tóquio para a Não Proliferação Nuclear e Desarmamento, além de integrar instituições como o Instituto Histórico e Geográfico Brasileiro (IHGB), o Instituto do Patrimônio Histórico e Artístico Nacional (IPHAN) e a Fundação Roberto Marinho.